MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 genome

Total Repeats: 5601

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_021081	ATG	2	6	2374112	2374117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_021081	GCT	2	6	2374169	2374174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4503	NC_021081	TGA	2	6	2374201	2374206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_021081	A	6	6	2374209	2374214	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_021081	GAT	2	6	2376281	2376286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_021081	CAG	2	6	2376325	2376330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4507	NC_021081	ATG	2	6	2376390	2376395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_021081	CAC	2	6	2383378	2383383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4509	NC_021081	CCT	2	6	2395204	2395209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4510	NC_021081	CGC	2	6	2395213	2395218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4511	NC_021081	ACC	2	6	2395335	2395340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4512	NC_021081	ACCG	2	8	2395369	2395376	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4513	NC_021081	TGAG	2	8	2399499	2399506	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_021081	TAC	2	6	2399556	2399561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4515	NC_021081	CTG	2	6	2399569	2399574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4516	NC_021081	G	6	6	2399620	2399625	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_021081	GGGC	2	8	2399629	2399636	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4518	NC_021081	TCA	2	6	2406395	2406400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4519	NC_021081	TGG	2	6	2406415	2406420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_021081	CCT	2	6	2407467	2407472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4521	NC_021081	CA	3	6	2407476	2407481	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4522	NC_021081	A	6	6	2407481	2407486	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_021081	GAC	2	6	2407551	2407556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4524	NC_021081	CCGG	2	8	2407640	2407647	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4525	NC_021081	AAG	2	6	2408095	2408100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_021081	GCT	2	6	2408245	2408250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4527	NC_021081	TTC	2	6	2408264	2408269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4528	NC_021081	TGAA	2	8	2408292	2408299	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4529	NC_021081	TGG	2	6	2408380	2408385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_021081	AC	3	6	2408417	2408422	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4531	NC_021081	CTG	2	6	2408431	2408436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4532	NC_021081	CGC	2	6	2408466	2408471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4533	NC_021081	CCA	2	6	2408474	2408479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4534	NC_021081	T	6	6	2408505	2408510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_021081	CCT	2	6	2413454	2413459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4536	NC_021081	GGA	2	6	2413482	2413487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_021081	TGT	2	6	2413533	2413538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_021081	TGC	2	6	2415791	2415796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4539	NC_021081	CAG	2	6	2415797	2415802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4540	NC_021081	A	6	6	2416344	2416349	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_021081	A	6	6	2416359	2416364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_021081	AATG	2	8	2416385	2416392	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_021081	GGC	2	6	2416411	2416416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4544	NC_021081	CTACAA	2	12	2416758	2416769	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4545	NC_021081	AT	3	6	2419201	2419206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_021081	AC	3	6	2419295	2419300	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4547	NC_021081	GTA	2	6	2419306	2419311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_021081	TA	4	8	2419332	2419339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_021081	CCA	2	6	2419343	2419348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4550	NC_021081	GAG	2	6	2419380	2419385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_021081	TTTG	2	8	2422434	2422441	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_021081	GCTG	2	8	2422493	2422500	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4553	NC_021081	GTTC	2	8	2422518	2422525	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4554	NC_021081	CCGA	2	8	2422595	2422602	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4555	NC_021081	ACC	2	6	2422657	2422662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4556	NC_021081	GCG	2	6	2422825	2422830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4557	NC_021081	GGA	2	6	2422848	2422853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_021081	TTC	2	6	2422856	2422861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4559	NC_021081	CGG	2	6	2422886	2422891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4560	NC_021081	AGG	2	6	2422924	2422929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_021081	TGG	2	6	2424211	2424216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_021081	TAG	2	6	2424322	2424327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_021081	TA	3	6	2424378	2424383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_021081	TTA	2	6	2425276	2425281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_021081	GT	3	6	2426122	2426127	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_021081	TGAG	2	8	2426186	2426193	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_021081	ATG	2	6	2428506	2428511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_021081	AGG	2	6	2433166	2433171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_021081	AGT	2	6	2434736	2434741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_021081	CA	3	6	2434768	2434773	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4571	NC_021081	G	6	6	2434855	2434860	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4572	NC_021081	CCA	2	6	2434863	2434868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4573	NC_021081	CG	3	6	2435884	2435889	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4574	NC_021081	GGT	2	6	2435947	2435952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_021081	CAC	2	6	2437765	2437770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4576	NC_021081	CTG	2	6	2440410	2440415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4577	NC_021081	G	6	6	2441995	2442000	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4578	NC_021081	GGT	2	6	2442011	2442016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_021081	GGT	2	6	2442071	2442076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_021081	C	6	6	2442137	2442142	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4581	NC_021081	CGA	2	6	2442196	2442201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4582	NC_021081	TGC	2	6	2442362	2442367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4583	NC_021081	GC	3	6	2442419	2442424	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4584	NC_021081	GCT	2	6	2442432	2442437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4585	NC_021081	GGCCC	2	10	2442444	2442453	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4586	NC_021081	AACC	2	8	2442553	2442560	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4587	NC_021081	TGC	3	9	2442584	2442592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4588	NC_021081	CCTG	2	8	2442596	2442603	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4589	NC_021081	G	6	6	2442618	2442623	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_021081	C	6	6	2442644	2442649	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4591	NC_021081	GCG	2	6	2442675	2442680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4592	NC_021081	CTG	2	6	2442718	2442723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4593	NC_021081	GGT	2	6	2442807	2442812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_021081	CGA	2	6	2442939	2442944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4595	NC_021081	GCG	2	6	2442965	2442970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4596	NC_021081	CAC	2	6	2443005	2443010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4597	NC_021081	GGGCC	2	10	2443032	2443041	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4598	NC_021081	GGC	2	6	2443074	2443079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4599	NC_021081	CCTGGC	2	12	2443080	2443091	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4600	NC_021081	GTGCT	2	10	2443120	2443129	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4601	NC_021081	AGG	2	6	2443139	2443144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_021081	G	8	8	2443187	2443194	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_021081	CCTGGG	2	12	2443224	2443235	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4604	NC_021081	CCGAGG	2	12	2443280	2443291	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4605	NC_021081	ACC	2	6	2443303	2443308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4606	NC_021081	GAG	2	6	2443321	2443326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_021081	GTG	2	6	2443330	2443335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_021081	GCC	2	6	2443370	2443375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4609	NC_021081	CTG	2	6	2443408	2443413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4610	NC_021081	CG	3	6	2443415	2443420	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4611	NC_021081	GCT	2	6	2443422	2443427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4612	NC_021081	GCGG	2	8	2443428	2443435	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4613	NC_021081	GCC	2	6	2443444	2443449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4614	NC_021081	GCA	2	6	2443452	2443457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4615	NC_021081	GGC	2	6	2443473	2443478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4616	NC_021081	GAAG	2	8	2443596	2443603	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4617	NC_021081	GCT	2	6	2443653	2443658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4618	NC_021081	CTG	2	6	2443669	2443674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4619	NC_021081	GGC	2	6	2443688	2443693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4620	NC_021081	GCGCT	2	10	2443702	2443711	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4621	NC_021081	CG	3	6	2443725	2443730	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4622	NC_021081	G	6	6	2443739	2443744	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4623	NC_021081	GGC	2	6	2443746	2443751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4624	NC_021081	ACC	2	6	2443763	2443768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4625	NC_021081	GCCCAC	2	12	2443834	2443845	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
4626	NC_021081	GTT	2	6	2443866	2443871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4627	NC_021081	TGG	2	6	2443988	2443993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4628	NC_021081	CCG	2	6	2444051	2444056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4629	NC_021081	GCC	2	6	2444058	2444063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4630	NC_021081	AGG	2	6	2444117	2444122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4631	NC_021081	CG	3	6	2444348	2444353	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4632	NC_021081	GGA	2	6	2444412	2444417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4633	NC_021081	GGC	2	6	2444455	2444460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4634	NC_021081	GTG	2	6	2444539	2444544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4635	NC_021081	G	6	6	2444544	2444549	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4636	NC_021081	GCC	2	6	2444566	2444571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4645	NC_021081	GTG	2	6	2447030	2447035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4646	NC_021081	CTGG	2	8	2448104	2448111	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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4649	NC_021081	TGGA	2	8	2448190	2448197	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4650	NC_021081	CCGA	2	8	2449776	2449783	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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4672	NC_021081	CTG	2	6	2468114	2468119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4759	NC_021081	TA	3	6	2519299	2519304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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